杭州碳硅智慧科技發(fā)展有限公司;之江實驗室張徐俊獲國家專利權(quán)
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龍圖騰網(wǎng)獲悉杭州碳硅智慧科技發(fā)展有限公司;之江實驗室申請的專利分子結(jié)合構(gòu)象確定方法及裝置獲國家發(fā)明授權(quán)專利權(quán),本發(fā)明授權(quán)專利權(quán)由國家知識產(chǎn)權(quán)局授予,授權(quán)公告號為:CN116580764B 。
龍圖騰網(wǎng)通過國家知識產(chǎn)權(quán)局官網(wǎng)在2025-08-12發(fā)布的發(fā)明授權(quán)授權(quán)公告中獲悉:該發(fā)明授權(quán)的專利申請?zhí)?專利號為:202310452223.0,技術(shù)領域涉及:G16B15/30;該發(fā)明授權(quán)分子結(jié)合構(gòu)象確定方法及裝置是由張徐俊;侯廷軍;陳廣勇;謝昌諭;康玉;沈超;王哲;王天玥;王二成;鄧亞峰;施慧設計研發(fā)完成,并于2023-04-21向國家知識產(chǎn)權(quán)局提交的專利申請。
本分子結(jié)合構(gòu)象確定方法及裝置在說明書摘要公布了:本申請?zhí)峁┝艘环N分子結(jié)合構(gòu)象確定方法及裝置。包括:獲取化學分子對應的分子圖,及蛋白質(zhì)對應的殘基圖;將所述分子圖和所述殘基圖輸入至分子對接模型,所述分子對接模型包括:分子圖編碼網(wǎng)絡層、殘基圖編碼網(wǎng)絡層和構(gòu)象預測網(wǎng)絡層;調(diào)用所述分子圖編碼網(wǎng)絡層對所述分子圖進行處理,更新所述分子圖的分子節(jié)點特征,并調(diào)用所述殘基圖編碼網(wǎng)絡層對所述殘基圖進行處理,更新所述殘基圖的蛋白節(jié)點特征;調(diào)用相互作用構(gòu)建模塊對更新后的殘基圖和分子圖進行圖節(jié)點對并新增邊處理,得到相互作用圖;調(diào)用所述構(gòu)象預測網(wǎng)絡層對所述相互作用圖進行處理,得到所述化學分子與所述蛋白質(zhì)之間的分子結(jié)合構(gòu)象。本申請可以提高結(jié)合構(gòu)象的預測精度和預測速度,以及虛擬篩選的篩選能力和命中率。
本發(fā)明授權(quán)分子結(jié)合構(gòu)象確定方法及裝置在權(quán)利要求書中公布了:1.一種分子結(jié)合構(gòu)象確定方法,其特征在于,所述方法包括: 獲取化學分子對應的分子圖,及蛋白質(zhì)對應的殘基圖; 將所述分子圖和所述殘基圖輸入至分子對接模型,所述分子對接模型包括:分子圖編碼網(wǎng)絡層、殘基圖編碼網(wǎng)絡層和構(gòu)象預測網(wǎng)絡層; 調(diào)用所述分子圖編碼網(wǎng)絡層對所述分子圖進行處理,更新所述分子圖的分子節(jié)點特征,并調(diào)用所述殘基圖編碼網(wǎng)絡層對所述殘基圖進行處理,更新所述殘基圖的蛋白節(jié)點特征; 調(diào)用相互作用構(gòu)建模塊對更新后的殘基圖和分子圖進行圖節(jié)點對并新增邊處理,得到相互作用圖; 調(diào)用所述構(gòu)象預測網(wǎng)絡層對所述相互作用圖進行處理,得到所述化學分子與所述蛋白質(zhì)之間的分子結(jié)合構(gòu)象; 所述分子圖編碼網(wǎng)絡層包括:線性層和多頭注意力圖神經(jīng)網(wǎng)絡層,所述調(diào)用所述分子圖編碼網(wǎng)絡層對所述分子圖進行處理,得到所述分子圖的分子節(jié)點特征,包括:調(diào)用所述線性層對所述分子圖內(nèi)的節(jié)點特征和邊特征進行維度統(tǒng)一處理,得到維度統(tǒng)一的節(jié)點特征和邊特征;調(diào)用所述多頭注意力圖神經(jīng)網(wǎng)絡層對所述維度統(tǒng)一的節(jié)點特征和邊特征進行特征處理,得到所述分子圖的分子節(jié)點特征; 所述調(diào)用所述殘基圖編碼網(wǎng)絡層對所述殘基圖進行處理,得到所述殘基圖的蛋白節(jié)點特征,包括:調(diào)用所述殘基圖編碼網(wǎng)絡層對所述蛋白質(zhì)的序列信息的編碼特征和所述殘基圖內(nèi)的殘基節(jié)點特征進行拼接處理,得到殘基拼接特征;調(diào)用所述殘基圖編碼網(wǎng)絡層對所述殘基拼接特征進行處理,得到所述殘基圖的蛋白節(jié)點特征; 所述調(diào)用所述構(gòu)象預測網(wǎng)絡層對所述相互作用圖進行處理,得到所述化學分子與所述蛋白質(zhì)之間的預測分子結(jié)合構(gòu)象,包括:對所述相互作用圖內(nèi)的節(jié)點向量表征進行歸一化處理,得到歸一化節(jié)點向量表征,并對所述相互作用圖內(nèi)的邊向量表征進行維度轉(zhuǎn)換處理,得到維度轉(zhuǎn)換向量表征;調(diào)用所述構(gòu)象預測網(wǎng)絡層對所述歸一化節(jié)點向量表征和所述維度轉(zhuǎn)換向量表征進行處理,得到所述化學分子與所述蛋白質(zhì)之間的分子結(jié)合構(gòu)象。
如需購買、轉(zhuǎn)讓、實施、許可或投資類似專利技術(shù),可聯(lián)系本專利的申請人或?qū)@麢?quán)人杭州碳硅智慧科技發(fā)展有限公司;之江實驗室,其通訊地址為:310018 浙江省杭州市錢塘新區(qū)下沙街道福城路291號和達藥谷中心6幢337室;或者聯(lián)系龍圖騰網(wǎng)官方客服,聯(lián)系龍圖騰網(wǎng)可撥打電話0551-65771310或微信搜索“龍圖騰網(wǎng)”。
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