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      中國科學院深圳先進技術研究院胡如云獲國家專利權

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      龍圖騰網獲悉中國科學院深圳先進技術研究院申請的專利一種機器學習引導的生物序列工程改造方法及裝置獲國家發明授權專利權,本發明授權專利權由國家知識產權局授予,授權公告號為:CN115249514B

      龍圖騰網通過國家知識產權局官網在2025-08-08發布的發明授權授權公告中獲悉:該發明授權的專利申請號/專利號為:202210769346.2,技術領域涉及:G16B20/50;該發明授權一種機器學習引導的生物序列工程改造方法及裝置是由胡如云;喬宇;司同設計研發完成,并于2022-07-01向國家知識產權局提交的專利申請。

      一種機器學習引導的生物序列工程改造方法及裝置在說明書摘要公布了:本發明提供了一種機器學習引導的生物序列工程改造方法及裝置。具體地,提供了一種貝葉斯優化引導的進化算法BO?EVO,結合貝葉斯優化Bayesianoptimization,BO和進化算法evolutionaryalgorithm,EVO,通過EVO解決BO通過暴力搜索整個設計空間定位全局最優時帶來的計算量過大的問題,同時,利用BO的探索性中和EVO的貪婪和欠探索的缺點,以實現機器學習模型與機器人實驗之間的高效迭代,以經濟地獲取高價值的蛋白新變體。采用本發明的方法有望實現高效和可擴展的計算和探索,提供高效的生物序列工程改造方案。

      本發明授權一種機器學習引導的生物序列工程改造方法及裝置在權利要求書中公布了:1.一種機器學習引導的生物序列工程改造方法,其特征在于,其包括以下步驟: S1數據獲取:獲得生物序列及其對應的適應度數據; S2模型訓練:通過對獲得的生物序列及其對應的適應度數據進行機器學習,以獲得生物序列的適應度預測模型及模型不確定度; S3獲取首個種子:通過基于適應度的采樣從步驟S1得的生物序列及其對應的適應度數據中獲得首個種子序列; S4突變子空間生成:對于步驟S3或S6獲得的種子序列的待突變位點進行隨機突變,突變后的生物序列集合形成突變子空間,其中隨機突變的單點突變率為待突變位點的倒數; S5突變子空間貝葉斯優化:在突變子空間上采用貝葉斯優化選取單個候選序列以待實驗查詢,其中采樣函數為UCB,代理模型為S2獲得的適應度預測模型; S6新種子生成:首先以S2獲得的預測模型預測S5獲得的候選序列的不確定度,若不確定度不高于2倍的本輪首個種子序列的不確定度,則該候選序列作為本輪次下一個種子序列,并用于形成下一個突變子空間;若不確定度高于2倍的本輪次首個種子序列的不確定度,則依據步驟S3獲取本輪次下一個種子序列,并用于形成下一個突變子空間; S7重復S4到S6的循環,直至滿足預設的通量的循環,獲得批量的待實驗查詢的候選序列; S8對S7獲得的批量的待實驗查詢的候選序列進行實驗,以獲得候選序列并檢測其對應的適應度值; S9將候選序列及其對應的適應度值補充到S1的生物序列及其對應的適應度數據中,并用于下一輪模型訓練,獲得下一輪次的生物序列的適應度預測模型及模型不確定度; S10以S6獲得的最新種子序列作為下一輪次的首個種子序列,并重復S4到S9直至滿足預設的輪次或篩選出期待的突變體。

      如需購買、轉讓、實施、許可或投資類似專利技術,可聯系本專利的申請人或專利權人中國科學院深圳先進技術研究院,其通訊地址為:518055 廣東省深圳市南山區深圳大學城學苑大道1068號;或者聯系龍圖騰網官方客服,聯系龍圖騰網可撥打電話0551-65771310或微信搜索“龍圖騰網”。

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