浙江科技大學楊佳瑤獲國家專利權
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龍圖騰網獲悉浙江科技大學申請的專利一種用于磁珠—核酸分離后序列質量評估的方法獲國家發明授權專利權,本發明授權專利權由國家知識產權局授予,授權公告號為:CN120260681B 。
龍圖騰網通過國家知識產權局官網在2025-08-12發布的發明授權授權公告中獲悉:該發明授權的專利申請號/專利號為:202510733137.6,技術領域涉及:G16B30/00;該發明授權一種用于磁珠—核酸分離后序列質量評估的方法是由楊佳瑤;王行行;盧宣羽;程逸菲;王宏鵬;黃俊設計研發完成,并于2025-06-04向國家知識產權局提交的專利申請。
本一種用于磁珠—核酸分離后序列質量評估的方法在說明書摘要公布了:本發明涉及序列質量評估領域,尤其涉及一種用于磁珠—核酸分離后序列質量評估的方法。包括:對經過磁珠分離后生成的核酸樣本進行測序,得到核酸序列集合及其對應的質量分數;對核酸序列集合進行預處理,得到預處理后的核酸序列集合,通過序列完整性評估算法計算得到核酸序列的完整性得分;并通過序列一致性評分算法計算得到序列一致性評分;通過綜合核酸序列的完整性得分和一致性評分計算得到綜合質量評分,并根據綜合質量評分將核酸序列劃分為不同的質量等級。解決了傳統方法在識別序列中的污染與錯誤時,僅依賴質量評分閾值,而未能綜合考慮序列的堿基分布均勻性和熵值的技術問題。
本發明授權一種用于磁珠—核酸分離后序列質量評估的方法在權利要求書中公布了:1.一種用于磁珠—核酸分離后序列質量評估的方法,其特征在于,包括以下步驟: S1.對經過磁珠分離后生成的核酸樣本進行測序,得到核酸序列集合及其對應的質量分數;對核酸序列集合進行預處理,得到預處理后的核酸序列集合,基于預處理后的核酸序列集合,通過序列完整性評估算法計算得到核酸序列的完整性得分,具體公式為: , 其中,表示第個核酸序列的完整性得分;表示對核酸序列中堿基集合進行求和運算;表示第個核酸序列中堿基出現的頻率;表示第個核酸序列的有效長度,;表示污染懲罰項,將污染比例與熵值結合,用冪指數的形式控制懲罰程度,即對低污染、高熵值核酸序列的懲罰較輕,對高污染、低熵值核酸序列的懲罰較強;表示第個核酸序列的堿基分布熵值,熵值通過計算核酸序列中堿基頻率的不確定性,量化其分布均勻性,熵值越高,則核酸序列中堿基分布越均勻,反之,低熵值則說明堿基分布偏倚,計算公式為:;為核酸序列中未知堿基的數量;表示第個核酸序列中的堿基數; S2.基于預處理后的核酸序列集合及其對應的質量分數,通過序列一致性評分算法計算得到序列一致性評分,具體公式為: , 其中,表示第個核酸序列的一致性評分,用于衡量核酸序列中低質量區域的影響;表示懲罰因子,用于調節低質量區域對核酸序列一致性評分的影響;表示第個核酸序列中低質量區域的數量,低質量區域定義為連續至少3個堿基的質量分數低于質量分數閾值的片段;表示第個低質量區域的長度權重,定義為第個低質量區域長度與核酸序列有效長度的比值;表示第個低質量區域的平均質量評分; 通過綜合核酸序列的完整性得分和一致性評分計算得到綜合質量評分,并根據綜合質量評分將核酸序列劃分為不同的質量等級,所述綜合質量評分的范圍在到之間,綜合質量評分越接近表示核酸序列質量越高,反之,綜合質量評分越接近則表示核酸序列質量較差; 綜合質量評分的計算公式為: , 其中,表示第個核酸序列的綜合質量評分;表示所有核酸序列中完整性評分的最大值,用于標準化完整性得分。
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