西湖大學郭天南獲國家專利權
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龍圖騰網獲悉西湖大學申請的專利一種基于壓力的蛋白分子間親和力的檢測方法獲國家發明授權專利權,本發明授權專利權由國家知識產權局授予,授權公告號為:CN116699043B 。
龍圖騰網通過國家知識產權局官網在2025-08-12發布的發明授權授權公告中獲悉:該發明授權的專利申請號/專利號為:202310109993.5,技術領域涉及:G01N30/06;該發明授權一種基于壓力的蛋白分子間親和力的檢測方法是由郭天南;劉志偉;張芳菲設計研發完成,并于2023-02-14向國家知識產權局提交的專利申請。
本一種基于壓力的蛋白分子間親和力的檢測方法在說明書摘要公布了:本發明涉及一種基于壓力的蛋白分子間親和力的檢測方法。該方法基于隨著壓力增強,分子間相互作用力逐漸被破壞的原理,使用壓力循環儀PCT提供不同的壓力環境,之后使用體積排阻柱分餾和DIA質譜檢測分析定量每個餾分中的分子信息,用于計算在不同壓力下每個分子在不同餾分中分布的差異,從而推算出不同的分子間相互作用力的大小。該方法為含有蛋白的樣本提供均一的能量,可以更穩定、更高效、更高通量地測量分子間親和力。
本發明授權一種基于壓力的蛋白分子間親和力的檢測方法在權利要求書中公布了:1.一種基于壓力檢測蛋白分子間親和力的方法,包括以下步驟: 1)將生物組織樣品在P 1至P n的一系列壓力下分別進行裂解,得到一系列裂解物,其中P 1表示第一壓力,P n表示第n壓力,n為3以上的整數,相鄰兩個壓力之差為定值; 2)對步驟1)得到各個壓力下的一系列裂解物進行離心,取上清,分別進行基于尺寸排阻色譜SEC的高效液相色譜分離,并收集餾分; 3)將步驟2)收集的餾分分別使用胰蛋白酶進行蛋白酶解為肽段; 4)對步驟3)蛋白酶解后的不同餾分分別以數據非依賴型采集(DIA)方式進行質譜數據采集; 5)對步驟4)中采集到的不同餾分的DIA質譜數據進行蛋白質搜庫分析以獲得蛋白質定量矩陣; 6)通過蛋白質定量矩陣,推斷出生物組織樣品中的蛋白分子在不同餾分中的豐度分布; 7)對各個餾分進行分組生成不同的窗口,根據要分析分子間作用力的目標蛋白分子對在各組餾分中的豐度分布進行相關性分析以計算出目標蛋白分子對的對應于各組餾分的相關系數; 8)基于目標蛋白分子對的對應于各組餾分的相關系數,鑒定目標蛋白分子對之間是否存在相互作用峰; 9)在目標蛋白分子對之間存在相互作用峰的情況下,利用各個壓力下的蛋白質定量矩陣計算對應的相互作用峰的峰面積,并通過以下公式計算蛋白分子對的親和力系數AF,其中,所述AF越大,所述目標蛋白分子對之間的親和力越強: 在以上公式中,表示第一壓力下的相互作用峰的峰面積,表示第n-1壓力下的相互作用峰的峰面積,為第n壓力下的相互作用峰的峰面積,表示第n-j-1壓力下的相互作用峰的峰面積,表示第n-j壓力下的相互作用峰的峰面積; 為相鄰壓力區間P n-j-1和P n-j的權重,表示對應的相鄰壓力區間的相互作用峰的峰面積變化程度-對于親和力系數AF的影響程度,其中,為壓力區間系數,為大于1的常數。
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