中國科學院深圳先進技術研究院張睿獲國家專利權
買專利賣專利找龍圖騰,真高效! 查專利查商標用IPTOP,全免費!專利年費監控用IP管家,真方便!
龍圖騰網獲悉中國科學院深圳先進技術研究院申請的專利一種基于圖神經網絡自監督聚類的單細胞識別方法及設備獲國家發明授權專利權,本發明授權專利權由國家知識產權局授予,授權公告號為:CN115798593B 。
龍圖騰網通過國家知識產權局官網在2025-08-12發布的發明授權授權公告中獲悉:該發明授權的專利申請號/專利號為:202211537928.4,技術領域涉及:G16B40/00;該發明授權一種基于圖神經網絡自監督聚類的單細胞識別方法及設備是由張睿;吳紅艷;蔡云鵬;林越;鄭奕嘉設計研發完成,并于2022-12-02向國家知識產權局提交的專利申請。
本一種基于圖神經網絡自監督聚類的單細胞識別方法及設備在說明書摘要公布了:本發明公開了一種基于圖神經網絡自監督聚類的單細胞識別方法及設備,所述方法包括:獲取不同批次的單細胞,對單細胞進行測序得到細胞基因計數矩陣,將接收到單細胞轉錄組數據構建細胞?基因圖網絡;構建多個細胞子圖,并對細胞子圖進行合并得到細胞互作圖網絡;獲取細胞互作圖網絡的低維單細胞測序數據,將低維單細胞測序數據輸入到變分自編碼器進行處理,并優化得到最優細胞高斯隱變量表征,并進行自監督單細胞聚類以完成單細胞的類型識別。本發明對跨批次的單細胞轉錄組數據,構建基因?細胞互作關系網絡及細胞表征并進行聚類,從而達到細胞類型的準確識別且針對批次效應、基因缺失等問題實現優化,為單細胞的下游分析精度提供保證。
本發明授權一種基于圖神經網絡自監督聚類的單細胞識別方法及設備在權利要求書中公布了:1.一種基于圖神經網絡自監督聚類的單細胞識別方法,其特征在于,所述基于圖神經網絡自監督聚類的單細胞識別方法包括: 獲取不同批次的單細胞,對所述單細胞進行測序得到細胞基因計數矩陣,基于所述細胞基因計數矩陣接收單細胞轉錄組數據,并基于所述單細胞轉錄組數據構建細胞-基因圖網絡; 基于所述細胞-基因圖網絡構建多個細胞子圖,并對所述細胞子圖進行合并得到單細胞的細胞互作圖網絡; 所述基于所述細胞-基因圖網絡構建多個細胞子圖,并對所述細胞子圖進行合并得到單細胞的細胞互作圖網絡,具體包括: 當所述細胞-基因圖網絡中存在兩個細胞與關聯基因均有邊連接時,對所述兩個細胞與所述關聯基因的權重進行求和平均計算得到所述兩個細胞的邊的權重,并基于所述邊的權重得到所述細胞-基因圖網絡中基因總數的細胞子圖; 若所述兩個細胞在多個所述細胞子圖中均存在邊連接,則對多個所述細胞子圖進行合并,對合并后細胞子圖中邊的權重進行求和平均計算得到合并后兩個細胞的邊的權重,并基于合并后的邊的權重得到單細胞的細胞互作圖網絡; 獲取所述細胞互作圖網絡的低維單細胞測序數據,將所述低維單細胞測序數據輸入到變分自編碼器進行處理,得到所述單細胞轉錄組數據的細胞高斯隱變量表征; 對所述細胞高斯隱變量表征進行優化得到最優細胞高斯隱變量表征,并基于所述最優細胞高斯隱變量表征對單細胞進行自監督單細胞聚類以完成單細胞的類型識別。
如需購買、轉讓、實施、許可或投資類似專利技術,可聯系本專利的申請人或專利權人中國科學院深圳先進技術研究院,其通訊地址為:518055 廣東省深圳市南山區西麗深圳大學城學苑大道1068號;或者聯系龍圖騰網官方客服,聯系龍圖騰網可撥打電話0551-65771310或微信搜索“龍圖騰網”。
1、本報告根據公開、合法渠道獲得相關數據和信息,力求客觀、公正,但并不保證數據的最終完整性和準確性。
2、報告中的分析和結論僅反映本公司于發布本報告當日的職業理解,僅供參考使用,不能作為本公司承擔任何法律責任的依據或者憑證。