西安電子科技大學郭杏莉獲國家專利權
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龍圖騰網獲悉西安電子科技大學申請的專利一種基于信息熵的基因表達模式發現系統及方法獲國家發明授權專利權,本發明授權專利權由國家知識產權局授予,授權公告號為:CN117198401B 。
龍圖騰網通過國家知識產權局官網在2025-08-15發布的發明授權授權公告中獲悉:該發明授權的專利申請號/專利號為:202311204385.9,技術領域涉及:G16B25/10;該發明授權一種基于信息熵的基因表達模式發現系統及方法是由郭杏莉;任玉潔;王焜設計研發完成,并于2023-09-18向國家知識產權局提交的專利申請。
本一種基于信息熵的基因表達模式發現系統及方法在說明書摘要公布了:本發明公開了一種基于信息熵的基因表達模式發現系統及方法,該系統包括:獲取模塊,用于獲取多種不同癌癥的疾病樣本和多種不同癌癥中z1種癌癥的正常樣本;每個樣本中包含多個不同基因的表達值和每個基因的注釋;預處理模塊,用于對疾病樣本和正常樣本分別進行預處理;映射模塊,用于對預處理的疾病樣本和預處理的正常樣本進行批次處理、離群值處理和映射與轉換以將表達值映射至可見光上,得到每種癌癥的疾病基因表達光譜和z1種癌癥中各癌癥的正常基因表達光譜;構建模塊,用于獲取人類不同組織的先驗表達數據以構建基因共表達網絡;預測模塊,用于基于疾病基因表達光譜、正常基因表達光譜和基因共表達網絡,預測與每種癌癥相關的lncRNA基因。
本發明授權一種基于信息熵的基因表達模式發現系統及方法在權利要求書中公布了:1.一種基于信息熵的基因表達模式發現系統,其特征在于,包括: 獲取模塊,用于獲取多種不同癌癥的疾病樣本和所述多種不同癌癥中z1種癌癥的正常樣本;每個樣本中包含多個不同基因的表達值和每個基因的注釋;所述多個不同基因中包含多種lncRNA;z1為正整數;每個樣本中包含n個基因中各個基因的表達值;每種癌癥具有m1個疾病樣本;所述z1種癌癥中各癌癥具有m2個正常樣本; 預處理模塊,用于對所述疾病樣本和所述正常樣本分別進行預處理;每種癌癥的預處理的疾病樣本為一個n1行m1列的預處理疾病矩陣,所述z1種癌癥中各癌癥的預處理的正常樣本為一個n2行m1列的預處理正常矩陣;n、m1和m2均為正整數,n1和n2小于或等于n; 映射模塊,用于對每種癌癥的所述預處理疾病矩陣進行批次處理和離群值處理,得到該癌癥的合理疾病矩陣,采用映射與轉換公式將該癌癥的合理疾病矩陣映射至多種可見光上,得到該癌癥的一個疾病基因表達光譜;當該癌癥具有所述預處理正常矩陣時,對所述預處理正常矩陣進行批次處理和離群值處理得到該癌癥的合理正常矩陣,采用映射與轉換公式將該癌癥的合理正常矩陣映射至多種可見光上,得到該癌癥的一個正常基因表達光譜;其中,所述映射與轉換公式的表達式為:,其中,表示每個合理疾病矩陣每個合理正常矩陣中的每個表達值,表示所在的合理疾病矩陣合理正常矩陣中的最大表達值,表示所在的合理疾病矩陣合理正常矩陣中的最小表達值,表示的映射后的波長,780和380分別表示可見光的最大波長和最小波長; 構建模塊,用于獲取人類不同組織的先驗表達數據,基于所述先驗表達數據構建基因共表達網絡; 預測模塊,用于對于每種癌癥的所述疾病基因表達光譜,計算所述疾病基因表達光譜中每個基因的信息熵,并當該癌癥具有所述正常基因表達光譜時,計算所述正常基因表達光譜中每個基因的信息熵,基于所述疾病基因表達光譜中每個基因的信息熵、所述正常基因表達光譜中每個基因的信息熵和所述基因共表達網絡,預測與每種癌癥相關的lncRNA。
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