中國科學院深圳先進技術研究院聶子昂獲國家專利權
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龍圖騰網獲悉中國科學院深圳先進技術研究院申請的專利DNA數據編解碼方法、裝置、計算機設備及存儲介質獲國家發明授權專利權,本發明授權專利權由國家知識產權局授予,授權公告號為:CN116864006B 。
龍圖騰網通過國家知識產權局官網在2025-08-15發布的發明授權授權公告中獲悉:該發明授權的專利申請號/專利號為:202310847818.6,技術領域涉及:G16B30/10;該發明授權DNA數據編解碼方法、裝置、計算機設備及存儲介質是由聶子昂;王洋;黃小羅;葉可江;須成忠設計研發完成,并于2023-07-11向國家知識產權局提交的專利申請。
本DNA數據編解碼方法、裝置、計算機設備及存儲介質在說明書摘要公布了:本申請涉及一種DNA數據編解碼方法、裝置、計算機設備以及存儲介質。所述方法包括:使用深度優先搜索算法對生成的基礎堿基序列進行篩選,得到符合預設條件的基礎堿基序列;從所述篩選后的基礎堿基序列中選擇第一設定數量的基礎堿基序列作為二進制數據編碼時使用的基礎堿基序列并構建映射表,選擇第二設定數量的基礎堿基序列作為用于替換禁忌序列的替換序列;根據映射表將待編碼的二進制數據編碼為DNA鏈的堿基序列,并利用所述替換序列對所述堿基序列中的禁忌序列進行替換。本申請實施例能夠將任意的二進制數據編碼為堿基序列,生成的堿基序列中不包含過長同聚物及禁忌序列,且GC含量均衡,能夠降低自行折疊產生二級結構的概率。
本發明授權DNA數據編解碼方法、裝置、計算機設備及存儲介質在權利要求書中公布了:1.一種DNA數據編解碼方法,其特征在于,包括: 設定初始序列,在初始序列結尾依次添加堿基,生成DNA鏈的基礎堿基序列,并使用深度優先搜索算法對所述基礎堿基序列進行篩選,得到符合預設條件的基礎堿基序列;所述預設條件包括同聚物長度、GC含量以及禁忌序列; 從所述篩選后的基礎堿基序列中選擇第一設定數量的基礎堿基序列作為二進制數據編碼時使用的基礎堿基序列,根據所述第一設定數量的基礎堿基序列與二進制數據的映射關系構建映射表,并選擇第二設定數量的基礎堿基序列作為用于替換禁忌序列的替換序列; 根據所述映射表將待編碼的二進制數據編碼為DNA鏈的堿基序列,并利用所述替換序列對所述堿基序列中的禁忌序列進行替換; 所述使用深度優先搜索算法對所述基礎堿基序列進行篩選,得到符合預設條件的基礎堿基序列具體為: 設定一個空字符串的初始序列S; 在初始序列S的結尾依次添加A、T、G、C四種堿基,生成基礎堿基序列S1、S2、S3…Sn,n代表生成的基礎堿基序列的總數,并在每生成一個基礎堿基序列后,使用深度優先搜索算法對該基礎堿基序列進行搜索,判斷所述基礎堿基序列中是否存在長度大于第一預設值的同聚物,如果存在, 在所述基礎堿基序列上停止搜索,并判斷所述基礎堿基序列的長度是否等于第二預設值,如果是, 判斷所述基礎堿基序列中堿基G和C的數量是否均達到第三預設值,如果是, 判斷所述基礎堿基序列中是否存在預先定義的禁忌序列,如果存在,刪除所述禁忌序列;如果不存在,將所述基礎堿基序列加入基礎堿基序列集合中。
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