北京大學(xué)白凡獲國(guó)家專利權(quán)
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龍圖騰網(wǎng)獲悉北京大學(xué)申請(qǐng)的專利一種基于單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序分析T淋巴細(xì)胞TCR特點(diǎn)的方法獲國(guó)家發(fā)明授權(quán)專利權(quán),本發(fā)明授權(quán)專利權(quán)由國(guó)家知識(shí)產(chǎn)權(quán)局授予,授權(quán)公告號(hào)為:CN115995267B 。
龍圖騰網(wǎng)通過(guò)國(guó)家知識(shí)產(chǎn)權(quán)局官網(wǎng)在2025-08-15發(fā)布的發(fā)明授權(quán)授權(quán)公告中獲悉:該發(fā)明授權(quán)的專利申請(qǐng)?zhí)?專利號(hào)為:202111213369.7,技術(shù)領(lǐng)域涉及:G16B30/10;該發(fā)明授權(quán)一種基于單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序分析T淋巴細(xì)胞TCR特點(diǎn)的方法是由白凡;邢旭東設(shè)計(jì)研發(fā)完成,并于2021-10-19向國(guó)家知識(shí)產(chǎn)權(quán)局提交的專利申請(qǐng)。
本一種基于單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序分析T淋巴細(xì)胞TCR特點(diǎn)的方法在說(shuō)明書摘要公布了:本發(fā)明公開(kāi)了一種基于單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序分析T淋巴細(xì)胞TCR特點(diǎn)的方法。該方法對(duì)特定病毒感染前后、治療前后的不同患者樣本進(jìn)行單細(xì)胞測(cè)序,基于單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序數(shù)據(jù)構(gòu)建單細(xì)胞基因表達(dá)矩陣并進(jìn)行細(xì)胞類型的注釋和分群,基于單細(xì)胞免疫組測(cè)序數(shù)據(jù)組裝TCR序列并識(shí)別TCR鏈組成基因,然后評(píng)估和識(shí)別各細(xì)胞亞群穩(wěn)定TCR的表達(dá)率,評(píng)估不同疾病狀態(tài)的各細(xì)胞亞群克隆狀態(tài)和各樣本TCR組裝與使用偏好性,以及分析同一患者治療前后TCR的變化特點(diǎn)。本發(fā)明對(duì)于特定病毒感染機(jī)制的解析以及針對(duì)宿主免疫反應(yīng)研發(fā)特定疫苗和藥物療法有著重要的意義。
本發(fā)明授權(quán)一種基于單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序分析T淋巴細(xì)胞TCR特點(diǎn)的方法在權(quán)利要求書中公布了:1.一種基于單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序數(shù)據(jù)全面分析病毒感染后T淋巴細(xì)胞TCR特點(diǎn)的方法,采集特定病毒感染前后、治療前后的不同患者的樣本進(jìn)行單細(xì)胞測(cè)序,然后通過(guò)以下步驟進(jìn)行分析: 1)基于單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序數(shù)據(jù)構(gòu)建單細(xì)胞基因表達(dá)矩陣,并進(jìn)行細(xì)胞類型的分群和注釋; 2)基于單細(xì)胞免疫組測(cè)序數(shù)據(jù)組裝TCR序列并識(shí)別TCR鏈組成基因; 3)結(jié)合表達(dá)數(shù)據(jù)識(shí)別各細(xì)胞亞群的穩(wěn)定TCR表達(dá)率:對(duì)步驟1)獲得的單細(xì)胞表達(dá)數(shù)據(jù)進(jìn)行數(shù)據(jù)過(guò)濾和去噪,只保留高質(zhì)量的單細(xì)胞表達(dá)數(shù)據(jù);在步驟2)組裝和識(shí)別的TCR序列后,只保留同時(shí)具有α和β鏈數(shù)據(jù)的TCR;識(shí)別出具有高質(zhì)量單細(xì)胞表達(dá)數(shù)據(jù)且同時(shí)具有α和β鏈的TCR的細(xì)胞,從而獲得各細(xì)胞亞群的穩(wěn)定TCR表達(dá)率,即各細(xì)胞亞群中檢測(cè)到穩(wěn)定TCR的細(xì)胞數(shù)占總細(xì)胞數(shù)的百分比; 4)評(píng)估不同疾病狀態(tài)的各細(xì)胞亞群克隆狀態(tài):定義每個(gè)獨(dú)特的TRAs-TRBs對(duì)為一個(gè)克隆型,如果一個(gè)克隆型存在于至少兩個(gè)細(xì)胞中,則攜帶該克隆型的細(xì)胞被認(rèn)為是克隆的;同時(shí)評(píng)估不同疾病狀態(tài)下的各細(xì)胞亞群中沒(méi)檢測(cè)到TCR、TCR不克隆以及TCR克隆的情況; 5)分析不同疾病狀態(tài)下各樣本TCR組裝與使用偏好性:通過(guò)分析不同患者、不同疾病狀態(tài)下各樣本的TCRα和β鏈V-J基因配對(duì)使用的特點(diǎn),解析不同疾病狀態(tài)下各樣本TCR組裝與使用偏好性;具體是:對(duì)于每個(gè)樣本,先獲得該樣本每個(gè)細(xì)胞TCR的克隆型組成,分別提取該細(xì)胞TRA和TRB中V-J基因的配對(duì)信息,進(jìn)而統(tǒng)計(jì)該樣本所有TCR中TRA和TRB的V-J基因配對(duì)使用的頻率;統(tǒng)計(jì)好所有樣本的TCRV-J配對(duì)使用情況后,將樣本按照不同的疾病狀態(tài)和不同的患者分組,選取每個(gè)樣本中高頻使用的V-J基因?qū)L制成圖,展示不同患者之間特異性的和共享的V基因、J基因和V-J基因?qū)?,以及不同疾病狀態(tài)之間特異性的和共享的V基因、J基因和V-J基因?qū)Γ纱私馕霾《靖腥竞笙啾冉】禒顟B(tài),以及抗病毒治療后差異性的高頻V-J基因?qū)κ褂玫钠眯裕?6)分析同一患者治療前后整體和特定細(xì)胞亞群的TCR變化的狀態(tài)、特異性和多樣性。
如需購(gòu)買、轉(zhuǎn)讓、實(shí)施、許可或投資類似專利技術(shù),可聯(lián)系本專利的申請(qǐng)人或?qū)@麢?quán)人北京大學(xué),其通訊地址為:100871 北京市海淀區(qū)頤和園路5號(hào);或者聯(lián)系龍圖騰網(wǎng)官方客服,聯(lián)系龍圖騰網(wǎng)可撥打電話0551-65771310或微信搜索“龍圖騰網(wǎng)”。
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