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龍圖騰網(wǎng)獲悉硅羿科技(上海)有限公司申請的專利基于熱力學(xué)參數(shù)的dsRNA/siRNA靶標設(shè)計方法、應(yīng)用及計算機程序產(chǎn)品獲國家發(fā)明授權(quán)專利權(quán)，本發(fā)明授權(quán)專利權(quán)由國家知識產(chǎn)權(quán)局授予，授權(quán)公告號為：CN120126561B 。

龍圖騰網(wǎng)通過國家知識產(chǎn)權(quán)局官網(wǎng)在2025-08-19發(fā)布的發(fā)明授權(quán)授權(quán)公告中獲悉：該發(fā)明授權(quán)的專利申請?zhí)?專利號為：202510525341.9，技術(shù)領(lǐng)域涉及：G16B30/00；該發(fā)明授權(quán)基于熱力學(xué)參數(shù)的dsRNA/siRNA靶標設(shè)計方法、應(yīng)用及計算機程序產(chǎn)品是由李敬彬;唐雪明;于佳梅;王仁杰;李佳寧設(shè)計研發(fā)完成，并于2025-04-25向國家知識產(chǎn)權(quán)局提交的專利申請。

本基于熱力學(xué)參數(shù)的dsRNA/siRNA靶標設(shè)計方法、應(yīng)用及計算機程序產(chǎn)品在說明書摘要公布了：本發(fā)明涉及生物信息技術(shù)領(lǐng)域，提供一種基于熱力學(xué)參數(shù)的dsRNAsiRNA靶標序列設(shè)計方法，包括對候選基因的編碼序列進行標準化處理；預(yù)設(shè)一個閱讀框，通過閱讀框的平移對候選基因的編碼序列進行分割，得到多個候選dsRNAsiRNA靶標序列；讀取并分析候選dsRNAsiRNA靶標序列，獲得所有候選dsRNAsiRNA靶標序列的堿基對；預(yù)設(shè)所有堿基對的熱力學(xué)參數(shù)，計算所有堿基對的熱力學(xué)參數(shù)之和，結(jié)合修正參數(shù)獲得候選靶標序列的最終熱力學(xué)參數(shù)；根據(jù)熱力學(xué)參數(shù)計算每個候選dsRNAsiRNA靶標序列的評分，將評分最高的確定為最優(yōu)的dsRNAsiRNA靶標序列。

本發(fā)明授權(quán)基于熱力學(xué)參數(shù)的dsRNA/siRNA靶標設(shè)計方法、應(yīng)用及計算機程序產(chǎn)品在權(quán)利要求書中公布了：1.一種基于熱力學(xué)參數(shù)的dsRNAsiRNA靶標序列設(shè)計方法，其特征在于，所述設(shè)計方法包括： （1）對候選基因的編碼序列進行標準化處理；標準化處理包括：序列檢查，分析編碼序列是否對稱；去冗余信息，確保編碼序列只包含AGCT的DNA序列；完成大小寫轉(zhuǎn)換，將編碼序列統(tǒng)一為大寫格式；將DNA序列的T轉(zhuǎn)換為U； （2）預(yù)設(shè)一個閱讀框的長度為a，平移的步長為b，通過閱讀框的平移對候選基因的編碼序列進行分割，得到多個候選dsRNAsiRNA靶標序列； （3）基于個體最近鄰模型讀取并分析候選dsRNAsiRNA靶標序列，獲得所有候選dsRNAsiRNA靶標序列的堿基對； （4）預(yù)設(shè)所有堿基對的熱力學(xué)參數(shù)，計算所有堿基對的熱力學(xué)參數(shù)之和，結(jié)合修正參數(shù)獲得候選dsRNAsiRNA靶標序列的最終熱力學(xué)參數(shù)； 最終熱力學(xué)參數(shù)FE的計算式為： FE=Gnn+Gsym+Gt1+Gt2+Gin； 其中，Gnn是基于最近鄰模型計算得到的堿基對能量參數(shù)之和； Gsym是用于衡量候選dsRNA靶標序列的結(jié)構(gòu)對稱性，若候選dsRNA靶標序列的結(jié)構(gòu)呈現(xiàn)對稱特征，Gsym取0.43，否則取0； Gt1是針對候選dsRNA靶標序列的首個堿基進行判斷，若第1個堿基為A或U時，Gt1取0.45，否則取0； Gt2是針對候選dsRNA靶標序列的最后一個堿基進行判斷，若最后一個堿基為A或U時，Gt2取0.45，否則取0； Gin是所有dsRNA靶標序列的補償值，用于對整體能量參數(shù)進行適當(dāng)?shù)男拚驼{(diào)整； （5）根據(jù)最終熱力學(xué)參數(shù)計算每個候選dsRNAsiRNA靶標序列的評分，并對評分進行排序，將評分最高的一個或多個候選dsRNAsiRNA靶標序列確定為最優(yōu)的dsRNAsiRNA靶標序列。

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