魯東大學(xué)趙魁獲國家專利權(quán)
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龍圖騰網(wǎng)獲悉魯東大學(xué)申請的專利一種互補(bǔ)決定區(qū)3與免疫表位結(jié)合預(yù)測方法獲國家發(fā)明授權(quán)專利權(quán),本發(fā)明授權(quán)專利權(quán)由國家知識產(chǎn)權(quán)局授予,授權(quán)公告號為:CN120319302B 。
龍圖騰網(wǎng)通過國家知識產(chǎn)權(quán)局官網(wǎng)在2025-08-19發(fā)布的發(fā)明授權(quán)授權(quán)公告中獲悉:該發(fā)明授權(quán)的專利申請?zhí)?專利號為:202510807630.8,技術(shù)領(lǐng)域涉及:G16B15/30;該發(fā)明授權(quán)一種互補(bǔ)決定區(qū)3與免疫表位結(jié)合預(yù)測方法是由趙魁;周樹森;劉通;柳嬋娟;王慶軍;臧睦君設(shè)計(jì)研發(fā)完成,并于2025-06-17向國家知識產(chǎn)權(quán)局提交的專利申請。
本一種互補(bǔ)決定區(qū)3與免疫表位結(jié)合預(yù)測方法在說明書摘要公布了:本發(fā)明提出一種互補(bǔ)決定區(qū)3與免疫表位結(jié)合預(yù)測方法,屬于生物信息學(xué)領(lǐng)域。該方法融合多模態(tài)異質(zhì)圖建模、圖注意力網(wǎng)絡(luò)(GAT)與多目標(biāo)損失函數(shù)協(xié)同優(yōu)化,旨在突破現(xiàn)有技術(shù)在異構(gòu)數(shù)據(jù)建模、類別不平衡及預(yù)測精度等方面的限制。通過構(gòu)建互補(bǔ)決定區(qū)3節(jié)點(diǎn)與免疫表位節(jié)點(diǎn)的異質(zhì)圖,引入GAT實(shí)現(xiàn)跨模態(tài)特征交互,并結(jié)合焦點(diǎn)損失函數(shù)與AUC損失函數(shù)動態(tài)權(quán)重優(yōu)化策略,提升模型對困難樣本的識別能力和整體排序性能。同時,通過注意力權(quán)重實(shí)現(xiàn)結(jié)合熱點(diǎn)殘基的可解釋性解析。本方法顯著提高了互補(bǔ)決定區(qū)3與免疫表位結(jié)合特異性的預(yù)測準(zhǔn)確率,可廣泛應(yīng)用于癌癥疫苗設(shè)計(jì)、個體化免疫治療及自身免疫病研究中,具有重要的理論意義和實(shí)際應(yīng)用價值。
本發(fā)明授權(quán)一種互補(bǔ)決定區(qū)3與免疫表位結(jié)合預(yù)測方法在權(quán)利要求書中公布了:1.一種互補(bǔ)決定區(qū)3與免疫表位結(jié)合預(yù)測方法,其特征在于,通過多模態(tài)異質(zhì)圖建模、動態(tài)邊初始化與多目標(biāo)損失函數(shù)協(xié)同優(yōu)化,顯著提高CDR3與免疫表位結(jié)合特異性的預(yù)測準(zhǔn)確率,互補(bǔ)決定區(qū)3簡稱CDR3,包括以下步驟: 步驟1、數(shù)據(jù)采集與多模態(tài)特征提取,從pMTnet、VDJdb等數(shù)據(jù)庫獲取CDR3序列與免疫表位肽段,經(jīng)過去噪、長度標(biāo)準(zhǔn)化、多模態(tài)特征提取對數(shù)據(jù)進(jìn)行處理; 步驟2、異質(zhì)圖構(gòu)建與動態(tài)邊初始化,定義節(jié)點(diǎn)分為CDR3節(jié)點(diǎn)和免疫表位節(jié)點(diǎn),CDR3節(jié)點(diǎn)特征維度為792,免疫表位節(jié)點(diǎn)特征維度為1292,邊分為兩類,正邊和負(fù)邊; 步驟3、圖注意力網(wǎng)絡(luò)設(shè)計(jì)與訓(xùn)練,圖注意力網(wǎng)絡(luò)簡稱GAT,GAT結(jié)構(gòu)為2層8頭注意力網(wǎng)絡(luò),輸出維度為128,之后進(jìn)行動態(tài)負(fù)樣本更新,生成對抗樣本并替換比例為20%的低置信度負(fù)樣本; 步驟4、多目標(biāo)損失函數(shù)協(xié)同優(yōu)化,本方法發(fā)明了多損失函數(shù)融合策略,解決類別不平衡問題,并進(jìn)行雙優(yōu)化器協(xié)同訓(xùn)練; 步驟5、可解釋性分析與結(jié)果輸出,提取GAT注意力權(quán)重,映射至CDR3與免疫表位殘基,對貢獻(xiàn)度≥0.15的殘基對輸出為結(jié)合熱點(diǎn),最后輸出結(jié)果,并生成CSV文件; 步驟6、模型驗(yàn)證與超參數(shù)調(diào)優(yōu),采用5折交叉驗(yàn)證,并以AUC作為評估指標(biāo); 步驟7、應(yīng)用輸出與實(shí)驗(yàn)結(jié)果,訓(xùn)練后最終輸出CSV文件,輸出實(shí)驗(yàn)結(jié)果。
如需購買、轉(zhuǎn)讓、實(shí)施、許可或投資類似專利技術(shù),可聯(lián)系本專利的申請人或?qū)@麢?quán)人魯東大學(xué),其通訊地址為:264025 山東省煙臺市芝罘區(qū)紅旗中路186號;或者聯(lián)系龍圖騰網(wǎng)官方客服,聯(lián)系龍圖騰網(wǎng)可撥打電話0551-65771310或微信搜索“龍圖騰網(wǎng)”。
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