中南大學曾敏獲國家專利權
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龍圖騰網獲悉中南大學申請的專利基于圖卷積網絡的lncRNA亞細胞定位預測方法、設備及介質獲國家發明授權專利權,本發明授權專利權由國家知識產權局授予,授權公告號為:CN115394348B 。
龍圖騰網通過國家知識產權局官網在2025-08-19發布的發明授權授權公告中獲悉:該發明授權的專利申請號/專利號為:202210829698.2,技術領域涉及:G16B5/00;該發明授權基于圖卷積網絡的lncRNA亞細胞定位預測方法、設備及介質是由曾敏;李敏;趙保瑩設計研發完成,并于2022-07-15向國家知識產權局提交的專利申請。
本基于圖卷積網絡的lncRNA亞細胞定位預測方法、設備及介質在說明書摘要公布了:本發明公開了一種基于圖卷積網絡的lncRNA亞細胞定位預測方法、設備及介質,方法包括:1將待測lncRNA序列轉換為k?mer形式的序列,以轉換后序列中各k?mer單元為節點進行構圖得到帶權有向圖,并對圖的邊權進行標準化處理得到邊權標準化的有向圖;2基于word2vec技術提取有向圖中各節點的分布式詞向量,并嵌入到邊權標準化的有向圖中;3采用預先訓練好的基于圖卷積網絡的預測模型,根據嵌入分布式詞向量的有向圖,對待測lncRNA序列進行亞細胞定位輸出。本發明比傳統機器學習模型和現有方法更好的預測性能。
本發明授權基于圖卷積網絡的lncRNA亞細胞定位預測方法、設備及介質在權利要求書中公布了:1.一種基于圖卷積網絡的lncRNA亞細胞定位預測方法,其特征在于,包括: (1)將待測lncRNA序列轉換為k-mer形式的序列,以轉換后序列中各k-mer單元為節點進行構圖得到帶權有向圖,并對圖的邊權進行標準化處理得到邊權標準化的有向圖; 步驟(1)具體過程為: 將待測lncRNA序列轉換為k-mer形式的序列,按順序依次將每個k-mer單元分配到節點上,并將相鄰的k-mer單元節點使用有向邊連接,以及將其中k-mer單元相同的節點粘合為一個,并得到無權有向圖,該無權有向圖為待測lncRNA序列的deBruijn圖; 基于相鄰節點構成的k+1-mer單元的頻數,給無權有向圖中每條有向邊分配權重,得到帶權有向圖; 按以下計算式對帶權有向圖中的邊權進行標準化處理,得到邊權標準化的有向圖: ; 式中,表示從節點指向節點的有向邊的原始分配權重,表示從節點指向節點的有向邊的原始分配權重,表示從節點指向節點的有向邊的原始分配權重,表示節點的所有鄰居節點的集合,表示從節點指向節點的有向邊在標準化處理后的權重; (2)基于word2vec技術提取有向圖中各節點的分布式詞向量,并嵌入到邊權標準化的有向圖中; (3)采用預先訓練好的基于圖卷積網絡的預測模型,根據嵌入分布式詞向量的有向圖,對待測lncRNA序列進行亞細胞定位輸出。
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